小麦16k

小麦16K液相芯片

博瑞迪小麦16K液相芯片(GenoBaits® Wheat 16K Panel)产品开发依托于西北农林科技大学康振生院士科研团队,以课题组20份重测序数据为基础,利用1,520份世界范围收集的种质资源的多平台基因分型数据、已公开发表的重测序、外显子捕获数据进行SNP筛选,使用博瑞迪GenoBaits®技术进行开发和优化,最终保留14,868个mSNP区段(37,669个SNP标记)构成16K液相芯片产品,可用于小麦种质资源评价和图谱构建。

产品特点及优势

代表性高,多样性信息丰富
16K液相芯片产品所使用标记来自于大样本量重测序数据和现今已公开的所有重测序数据,这些数据的材料背景涵盖了全球各个区域(春小麦区和冬小麦区)的小麦主要的品种(野生种、农家种或栽培种)。
标记分布均匀
16K液相芯片产品标记设计优化后,每条染色体约含1,800个SNP标记。
同等标记密度,更低价格
16K液相芯片产品按照14,868个mSNP标记区段进行价格核算,最终可提供多达37,669个SNP标记的实际分型结果,极大程度降低了分子辅助育种的使用成本,产品较同类型其他产品价格低20%。

产品应用方向

科学研究
遗传图谱构建
QTL分析
全基因组关联分析(GWAS)
育种应用
种质资源基轩型鉴定
分子标记辅助育种全,基因组选择育种
遗传相似度分析,亲缘关系分析
品种保护,真实性鉴定

服务流程

产品数据表现

产品应用案例

通过小麦16K液相芯片对200份YACO'S'/铭贤169RIL7家系材料进行检测及基因分型,共得到标记数据14,868个,选取亲本间有差异的标记共4,883个用于构建遗传图谱,使用QTL ICIMAPPING4.2软件,结合4个环境下的表型性状和遗传图谱信息进行基因数定位,分别在2BS和3BS上定位到了2个稳定的QTL。

小麦物种系列产品

参考文献

[1] Juliana, P. et al. 2019. Improving grain yield, stress resilience and quality of bread wheat using large-scale genomics. Nature Genetics, 51(10):153o-1539.
[2] Cheng, H. et al. 2019. Frequentintra- and inter-species introgression shapes the landscape of genetic variation in bread wheat. Genome Biol 2o, 136.
[3] Wu, J. et al. 2020. Association Analysis Identifies New Loci for Resistance to Chinese Yr26-Virulent Races of the Stripe Rust Pathogen in a Diverse Panel of Wheat Gemplasm. Plant Dis 104, 1751-1762.
[4] Wu, J. et al. 2o21. A large-scale genomic association analysis identifies the candidate causal genes conferring stripe rust resistance under multiple field environments. Plant Biotechnol J 19, 177-191.
[5] Juliana, P. et al. 2019. Improving grain yield, stress resilience and quality of bread wheat using large-scale genomics. Nature Genetics, 51(10):153o-1539.